Для удаления файла используйте Bun.file(path).delete().
ts
// Удалить файл
const file = Bun.file("path/to/file.txt");
await file.delete();
// Теперь файл не существует
const exists = await file.exists();
// => falseСмотрите Документация > API > Файловая система для получения дополнительной информации о файловых операциях.