Bun implementa as funções padrão da Web atob e btoa para codificar e decodificar strings base64.

const data = "hello world";
const encoded = btoa(data); // => "aGVsbG8gd29ybGQ="
const decoded = atob(encoded); // => "hello world"

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Consulte Docs > Web APIs para uma explicação completa das Web APIs implementadas no Bun.