Bun implementa las funciones atob y btoa estándar de la Web para codificar y decodificar cadenas base64.

const data = "hello world";
const encoded = btoa(data); // => "aGVsbG8gd29ybGQ="
const decoded = atob(encoded); // => "hello world"

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Consulta Documentación > APIs Web para un desglose completo de las APIs Web implementadas en Bun.