Para agregar un paquete npm como una dependencia opcional, usa el flag --optional.

bun add zod --optional

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Esto agregará el paquete a optionalDependencies en package.json.

{
  "optionalDependencies": {
    "zod": "^3.0.0"
  }
}

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Consulta Documentación > Gestor de paquetes para la documentación completa del gestor de paquetes de Bun.